MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7424 plasmid pP742404

Total Repeats: 152

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011732	AAT	2	6	66	71	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011732	T	6	6	100	105	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011732	TTG	2	6	148	153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011732	TAAAG	2	10	158	167	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011732	ATT	3	9	187	195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011732	GATT	2	8	196	203	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011732	T	6	6	202	207	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011732	GAT	2	6	231	236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011732	AT	3	6	2436	2441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011732	CCTA	2	8	2468	2475	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_011732	CGT	2	6	2514	2519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_011732	C	6	6	2555	2560	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13	NC_011732	AT	3	6	2622	2627	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011732	TTC	2	6	4312	4317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_011732	TCC	3	9	4337	4345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_011732	GACTT	2	10	4407	4416	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_011732	ATA	2	6	4428	4433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011732	TAT	2	6	4455	4460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011732	TCG	2	6	4497	4502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_011732	CATGA	2	10	4560	4569	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_011732	ATTT	2	8	4599	4606	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011732	T	7	7	4685	4691	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011732	GT	3	6	4692	4697	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011732	TGT	2	6	4706	4711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011732	CT	3	6	4755	4760	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_011732	GAA	2	6	4794	4799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011732	TA	3	6	4807	4812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011732	GCA	2	6	4815	4820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_011732	GCTT	2	8	4823	4830	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_011732	CA	3	6	4926	4931	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_011732	CTT	2	6	4934	4939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_011732	AGT	2	6	4967	4972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011732	T	6	6	5047	5052	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011732	CTT	2	6	5053	5058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_011732	T	8	8	5057	5064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011732	GAGAA	2	10	5065	5074	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011732	TCT	2	6	5090	5095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_011732	A	9	9	5111	5119	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011732	CTT	2	6	5167	5172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_011732	GACA	2	8	5185	5192	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_011732	TGAATG	2	12	5196	5207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011732	AAG	2	6	5208	5213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011732	CTT	2	6	5233	5238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_011732	CTT	2	6	5243	5248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_011732	T	6	6	5287	5292	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011732	AT	3	6	5326	5331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011732	T	6	6	5400	5405	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011732	AGT	2	6	5407	5412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011732	AAAT	2	8	5419	5426	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011732	AATT	2	8	5483	5490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011732	CAAC	2	8	5562	5569	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_011732	TTA	2	6	5592	5597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011732	GAA	2	6	5624	5629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011732	GCTT	2	8	5795	5802	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_011732	TAC	2	6	5818	5823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_011732	AAT	2	6	5830	5835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011732	TGAGA	2	10	5869	5878	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011732	GT	3	6	5893	5898	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011732	GAT	2	6	5972	5977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011732	GAG	2	6	5983	5988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011732	T	7	7	5999	6005	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011732	ATG	2	6	6013	6018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011732	ACT	2	6	6049	6054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_011732	AAGTC	2	10	6071	6080	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_011732	A	6	6	6081	6086	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011732	GTT	3	9	6099	6107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011732	AG	3	6	6561	6566	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011732	T	7	7	6594	6600	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011732	TG	3	6	6643	6648	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011732	TAA	2	6	6723	6728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011732	TAC	2	6	6757	6762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_011732	ATA	2	6	6792	6797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011732	T	6	6	7091	7096	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011732	TAT	2	6	7100	7105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011732	TTG	2	6	7138	7143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011732	TGA	2	6	7195	7200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011732	CCA	2	6	7214	7219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_011732	CAAGC	2	10	7266	7275	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
79	NC_011732	A	8	8	7320	7327	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011732	A	9	9	7365	7373	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011732	A	6	6	7383	7388	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011732	AT	3	6	7449	7454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011732	ACA	2	6	7464	7469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_011732	ATCCC	2	10	7480	7489	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
85	NC_011732	ATTA	2	8	7522	7529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011732	GT	5	10	10552	10561	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011732	T	8	8	10578	10585	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011732	GTA	2	6	10635	10640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011732	GTC	2	6	10707	10712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_011732	CAA	2	6	10716	10721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_011732	GGA	2	6	11831	11836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011732	TTTA	2	8	12675	12682	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011732	CCG	2	6	12897	12902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_011732	CAG	2	6	12941	12946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_011732	GTTT	2	8	13002	13009	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011732	T	6	6	13021	13026	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011732	CAGTA	2	10	13091	13100	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_011732	TAA	2	6	13131	13136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011732	GCC	2	6	13153	13158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_011732	GTTG	2	8	13168	13175	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011732	CTT	2	6	13201	13206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_011732	GGA	2	6	13210	13215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011732	A	6	6	13234	13239	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011732	ATT	2	6	13260	13265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011732	ATC	2	6	13266	13271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_011732	CTT	2	6	13273	13278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_011732	A	8	8	14877	14884	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011732	ACG	2	6	14886	14891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_011732	A	7	7	14951	14957	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011732	A	7	7	15023	15029	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011732	GTG	2	6	15071	15076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011732	AGT	3	9	15151	15159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011732	GTACA	2	10	15182	15191	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_011732	T	6	6	15977	15982	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011732	TCA	2	6	16017	16022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_011732	AGT	2	6	16057	16062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011732	AAT	2	6	16186	16191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011732	T	7	7	16191	16197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011732	AT	3	6	16200	16205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011732	GCA	2	6	16210	16215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_011732	A	6	6	16229	16234	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011732	A	6	6	16262	16267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011732	AG	3	6	16271	16276	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011732	AG	3	6	16316	16321	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011732	TAC	2	6	16346	16351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_011732	AG	3	6	16630	16635	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011732	T	6	6	17105	17110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011732	CTG	2	6	17166	17171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_011732	T	6	6	17218	17223	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011732	A	6	6	17285	17290	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011732	A	6	6	17402	17407	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011732	T	6	6	17427	17432	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011732	ATT	2	6	17470	17475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011732	ATTT	2	8	17536	17543	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011732	A	8	8	17567	17574	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011732	CTGA	2	8	17575	17582	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_011732	ATA	2	6	17669	17674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011732	T	6	6	17697	17702	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011732	TTC	2	6	17725	17730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_011732	TAT	2	6	17800	17805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011732	TTA	2	6	17874	17879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011732	T	7	7	17915	17921	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011732	TTG	2	6	19124	19129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011732	ATT	2	6	19196	19201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011732	A	6	6	19221	19226	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_011732	ACA	2	6	19265	19270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_011732	GCT	2	6	19278	19283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_011732	AT	3	6	19366	19371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_011732	AACA	2	8	19377	19384	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_011732	ATG	2	6	20319	20324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_011732	ATT	2	6	22547	22552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_011732	CTT	2	6	22581	22586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.